細胞STR鑒定
細胞STR鑒定應用于生物醫學研究領域的哺乳動物細胞被錯誤鑒定和交叉污染的問題,一直是一個普遍存在的突出問題。
據統計,國外實驗室有20%左右的細胞株被錯誤鑒定和交叉污染,NIH和ATCC近兩年都對此發出呼吁,要求研究者對細胞進行鑒定。近年來,大量研究表明STR基因分型方法是進行細胞交叉污染和性質鑒定的更有效和準確的方法之一,STR基因分型應用于細胞鑒定已被ATCC等機構強烈推薦。美國的ATCC細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR分型提供了各細胞株的數據供比對。
STR(Short Tandem Repeat,短串聯重復序列)基因位點由長度為3-7個堿基對的短串連重復序列組成,這些重復序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多態性標記,被稱為細胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈式反應)來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴增區域內重復序列的拷貝數的不同來區分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據所得的STR分型結果與專業的細胞STR數據庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。

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